アップデートしたら色々動かなくなった。

　BSD Subsystem, installerなどをアップデートしたら、sambaが動かなくなったり、lsが--color=ttyを受け付けなくなったり、screenshotが動かなくなったりと、寒い状況に。。。

追記

　諸悪の根源はどうもDock。こちらの通り行ったら解決しました。lsコマンドは治らないけど。